Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Usp43Q8BUM9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp43Q8BUM9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp43Q8BUM9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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