Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp54Q8BL06 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms