Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130040H23RikQ8BII3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms