Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim23Q8BGX0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim23Q8BGX0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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