Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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