Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.2Q85ZW9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.2Q85ZW9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms