Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5bQ80Y84 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms