Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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