Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fancd2Q80V62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fancd2Q80V62 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms