Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms