Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcmf1Q80UY2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcmf1Q80UY2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms