Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actr5Q80US4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actr5Q80US4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms