Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSD4

Tbata, Protein TBATA, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbataQ7TSD4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbataQ7TSD4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms