Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vma21Q78T54 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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