Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms