Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd3Q6ZQK0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms