Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Topbp1Q6ZQF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms