Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Glis3Q6XP49 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms