Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc44a1Q6X893 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms