Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift172Q6VH22 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms