Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms