Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms