Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trak1Q6PD31 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms