Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms