Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbtb40Q6PCS8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbtb40Q6PCS8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms