Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp200Q6P4T2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms