Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms