Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms