Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms