Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HelbQ6NVF4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms