Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms