Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms