Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms