Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ric1Q69ZJ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms