Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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