Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms