Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Papd5Q68ED3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms