Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms