Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms