Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha6Q62413 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms