Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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AtmQ62388 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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AtmQ62388 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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AtmQ62388 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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