Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms