Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms