Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcfQ61164 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms