Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nab1Q61122 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nab1Q61122 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms