Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms