Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RelnQ60841 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RelnQ60841 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms