Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rasa3Q60790 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rasa3Q60790 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rasa3Q60790 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rasa3Q60790 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rasa3Q60790 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rasa3Q60790 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasa3Q60790 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms