Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms