Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms